Program je zaměřený na multilaterální regionální spolupráci v rámci sítí univerzit. Jeho cílem je vytvořit středoevropskou univerzitní síť složenou z jednotlivých dílčích sítí programu. Síť je tvořena nejméně třemi vysokými školami, přičemž alespoň dvě z nich jsou z různých smluvních států. Vysoké školy, které se programu účastní, spolupracují na řešení odborné problematiky v rámci sítě.
Od akademického roku 2014/2015 se programu mohou účastnit kromě veřejných vysokých škol také soukromé vysoké školy se statutem o.p.s.
Dohodu o CEEPUS II podepsaly tyto země (řazené abecedně, nikoli tak, jak k Dohodě přistupovaly): Albánie, Bosna a Hercegovina, Bulharsko, Černá Hora, Česká republika, Chorvatsko, Maďarsko, Moldavsko,Makedonie/FYROM, Polsko, Rakousko, Rumunsko, Slovensko, Slovinsko a Srbsko; spolupracuje i Kosovo.
Program CEEPUS je určen pro pregraduální studenty/studentky od ukončení druhého semestru, postgraduální studenty/studentky a akademické pracovníky/pracovnice. Země, které se programu účastní, vkládají každoročně do programu určitý počet stipendijních měsíců určený pro přijetí zahraničních studentů a učitelů. CEEPUS je založen na reciprocitě výměn.
Do sítě se lze také přihlásit jako tzv. „freemover“ v případě, že domovská škola studenta-žadatele/studentky-žadatelky není zapojena do vhodné sítě.
Při příležitosti 16. zasedání Společného výboru ministrů školství podepsali zástupci členských zemí programu CEEPUS dne 25.3.2010 v Budvě (Černá Hora) Dohodu o Středoevropském výměnném programu pro univerzitní studia (CEEPUS III), která vstoupila v platnost 1. května 2011 a navázala na Dohodu CEEPUS II. Česká republika podepsala Dohodu CEEPUS III s výhradou k ustanovení článku 8, který se týká arbitrážní procedury jako způsobu řešení sporů týkajících se výkladu nebo provádění Dohody nebo pracovního programu.
Detailní informace o podmínkách účasti v programu CEEPUS jsou publikovány na stránkách Domu zahraničních služeb (www.dzs.cz, CEEPUS). Další informace jsou k dispozici rovněž na stránkách Ústřední kanceláře programu CEEPUS ve Vídni (www.ceepus.info).
